Comenzó el Torneo Juvenil de AFA de la temporada 2025 y Boca Juniors logró vencer a Sarmiento de Junín en las seis categorías. Su estructura juvenil para este año está integrada por ex futbolistas del club y trabaja con duplas técnicas en las distintas divisiones. Clemente Rodriguez, Pablo Ledesma y Antonio Barijho son algunos de los ex jugadores con pasado xeneize que se encuentran entrenando a los juveniles de Boca Juniors.
| Categorías | Director Técnico |
| Cuarta División | Silvio Rudman – Matías Gimenez |
| Quinta División | Walter Pico – Clemente Rodriguez |
| Sexta División | Pablo Ledesma – Daniel Díaz |
| Séptima División | Antonio Barijho – Martín Andrizzi |
| Octava División | Roberto Pompei – Enrique Álvarez |
| Novena División | Mauro Navas – Matías Arce |
Por otra parte, Mariano Herrón continúa como DT de la Reserva.